基序
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英文motif的縮寫。
也翻譯為“模序”，“模體”
例如，在反式作用因子的結(jié)構(gòu)中，基序一般指構(gòu)成任何一種特征序列的基本結(jié)構(gòu)，作為結(jié)構(gòu)域中的亞單元，其功能是體現(xiàn)結(jié)構(gòu)域的多種生物學(xué)作用。
反式作用因子的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA binding domain)中的幾種常見基序：
①螺旋/轉(zhuǎn)角/螺旋（Helix-turn-helix,HTH）基序
兩段螺旋被一短的轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)分開，其中一段螺旋為DNA識別螺旋．
同源異形結(jié)構(gòu)域(Homeodomain，由同源異形盒編碼)中含有HTH基序。具有Homeodomain的轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白在胚胎發(fā)育和正常細(xì)胞分化的基因表達(dá)調(diào)節(jié)中有重要作用。
②鋅指(Zinc finger)基序
由肽鏈的保守序列中的一對組氨酸加一對半胱氨酸(His2／Cys2)或2對半胱氨酸(cys2／cys2)與一個鋅離子形成配位鍵，這些氨基酸對之間的多膚鏈成環(huán)狀突出并折迭成指形結(jié)構(gòu)，多個指結(jié)構(gòu)常串聯(lián)重復(fù)。
鋅指族轉(zhuǎn)錄因子以二聚體形式同DNA上的順式調(diào)控元件結(jié)合。
含鋅指基序的轉(zhuǎn)錄因子：與GC盒結(jié)合的SPl、類固醇激素受體家族，抑癌蛋白WT1等。
③亮氨酸拉鏈(Leucine-Zipper)基序
由一段每隔6個a a 就有一個Leu的伸展肽鏈組成，這些周期性出現(xiàn)的Leu都位于α-螺旋的同—側(cè)面，因此兩條均含Leu拉鏈基序的蛋白質(zhì)通過亮氨酸側(cè)鏈的相互作用形成二聚體。
具有亮氨酸拉鏈基序的轉(zhuǎn)錄因子：原癌基因C-Jun/C-fos(APl家族)
④螺旋-環(huán)-螺旋(Helix-loop-Helix，HLHt)基序．
由2個α螺旋間隔一個非螺旋的環(huán)(loop)組成．
如原癌基因產(chǎn)物C-myc及其結(jié)合蛋白Max．
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